BLAST es un algoritmo informático que está disponible para su uso en línea en el sitio web del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI), así como en muchos otros sitios. BLAST puede alinear y comparar rápidamente una secuencia de ADN de consulta con una base de datos de secuencias, lo que la convierte en una herramienta crítica en la investigación genómica en curso.
¿BLAST es una base de datos primaria?
BLAST es el software más utilizado en la investigación bioinformática. Su función principal es comparar una secuencia de interés, la secuencia de consulta, con secuencias en una base de datos grande BLAST luego informa las mejores coincidencias, o "aciertos", que se encuentran en la base de datos. Este sencillo programa tiene dos aplicaciones principales.
¿El NCBI es una base de datos?
El NCBI alberga una serie de bases de datos relevantes para la biotecnología y la biomedicina y es un recurso importante para herramientas y servicios bioinformáticos. Las principales bases de datos incluyen GenBank para secuencias de ADN y PubMed, una base de datos bibliográfica para literatura biomédica. Otras bases de datos incluyen la base de datos NCBI Epigenomics.
¿BLAST solo se emplea en las bases de datos del NCBI?
BLAST está disponible en la web en el sitio web del NCBI. Hay diferentes tipos de BLAST disponibles según las secuencias de consulta y las bases de datos de destino.
¿Cómo funciona la base de datos BLAST?
¿Cómo funciona BLAST? BLAST identifica secuencias homólogas usando un método heurístico que inicialmente encuentra coincidencias cortas entre dos secuencias; por tanto, el método no tiene en cuenta todo el espacio de la secuencia. Después del partido inicial, BLAST intenta iniciar alineaciones locales a partir de estos partidos iniciales.
