Tabla de contenido:
- ¿Qué es el formato bigWig?
- ¿Cómo uso el archivo bigWig?
- ¿Qué es una pista bigWig?
- ¿Cómo creo un archivo bigWig?
Video: ¿Qué es el archivo bigwig?
2024 Autor: Fiona Howard | [email protected]. Última modificación: 2024-01-10 06:36
BigWig es un formato de archivo para la visualización de datos densos y continuos en una pista de navegador de genoma, creado mediante la conversión del formato Wiggle (WIG). El formato BigWig se describe en el sitio web de UCSC Genome Bioinformatics, y la guía de formato de archivo del Broad Institute proporciona información adicional.
¿Qué es el formato bigWig?
El formato bigWig es para mostrar datos densos y continuos que se mostrarán como un gráfico Los archivos BigWig se crean inicialmente a partir de archivos de tipo WIG, utilizando el programa UCSC wigToBigWig. Alternativamente, los archivos bigWig se pueden crear a partir de archivos bedGraph, usando el programa UCSC bedGraphToBigWig.
¿Cómo uso el archivo bigWig?
Mueva el archivo bigWig recién creado (myBigWig.bw) a una ubicación http, https o ftp accesible desde la web. Pegue la URL en el formulario de entrada de pista personalizada o construya una pista personalizada utilizando una sola línea de pista. Pegue la línea de seguimiento personalizado en el cuadro de texto de la página de administración de seguimiento personalizado.
¿Qué es una pista bigWig?
Las pistas
bigWig son pistas para señales continuas en todo el genoma. Son adecuados para mostrar varios resultados de experimentos "sin procesar", como señales ChIP-Seq, señales RNA-Seq, etc.
¿Cómo creo un archivo bigWig?
Hay varias formas de generar archivos de peces gordos. Esto generalmente implica convertir un archivo. bam en una pista de movimiento (.wig) y luego convertir la pista de movimiento en un pez gordo binario (.
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